271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2474 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  235  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  79.49 
 
 		 132 aa  190  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  58.47 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  59.83 
 
 		 118 aa  113  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  52.14 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  50.86 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  53.85 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  51.3 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  53.72 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  50.86 
 
 		 121 aa  106  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  50.85 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  45.97 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  55.17 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  54.05 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  48.74 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  51.35 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  48.28 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  51.72 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  46.09 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.36 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  49.15 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  45.87 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  49.11 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  43.59 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  40.94 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  49.49 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  41.44 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  46.36 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  42.59 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  45.71 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41.38 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  42.24 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  46.88 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  41.23 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  41.96 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  41.23 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  41.23 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  45.92 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  40.35 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  46.51 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  42.11 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  42.73 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  41.82 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  36.21 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.12 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  44.35 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.45 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  39.58 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  46.36 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.45 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  45.54 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  40.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  45.26 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.27 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  43.52 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.91 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  38.94 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.2 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.91 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  42.27 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  37.07 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.96 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  45.22 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  37.27 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.83 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  42.27 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  44.35 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.38 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  38.89 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.83 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  46.85 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.09 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 172 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  31.62 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.44 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  41.84 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.78 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  36.19 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.14 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.4 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  38.3 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  45.79 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  44.79 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.24 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>