276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2031 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  267  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  267  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  98.52 
 
 
135 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  65.67 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  70.83 
 
 
123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  73.33 
 
 
121 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  52.21 
 
 
119 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  49.59 
 
 
127 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.41 
 
 
125 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  51.72 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  52.58 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  47.37 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  46.55 
 
 
122 aa  94  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45.61 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.9 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  48.41 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  43.24 
 
 
122 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.86 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  53.61 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  42.74 
 
 
124 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  39.67 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  51.82 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  39.5 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  47.69 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  44.07 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.96 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.96 
 
 
128 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  41.23 
 
 
118 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  40.37 
 
 
140 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  44.92 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  37.61 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  36.63 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.18 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.64 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  42.61 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  44.07 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35.96 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  51.9 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  39.62 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  42.86 
 
 
202 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 
173 aa  76.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.51 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  47.52 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35.51 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  49.57 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  45.69 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  38.32 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  39.62 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35.51 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  44.33 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  35.54 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  48.31 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  44.35 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  44.63 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.1 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  42.71 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.62 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  42.55 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  40.68 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.94 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.45 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  40.21 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.79 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  42 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34.58 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  43.3 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  39.18 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.94 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  41.84 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  41.84 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  36.84 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  41.84 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  32.11 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  40.43 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  40.43 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  33.91 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.78 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  34 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  33.06 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.03 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1371  protein of unknown function UPF0102  40.2 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.4 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.58 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  36.73 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.74 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.19 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>