299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1992 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  63.56 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  60.83 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  57.5 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  50.83 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  53.72 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  46.51 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  47.01 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  47.86 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.76 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  45.38 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  39.32 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  46.72 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  44.26 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45.69 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  38.52 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  42.31 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  45.16 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40.34 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  40.16 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  39.47 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  38.98 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  45.54 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  42.06 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  42.06 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.52 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  43.7 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40.38 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  44.92 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  44.14 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  35.59 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40.48 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  40.18 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  42.37 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  43.43 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  40.34 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.34 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  41.75 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  41.53 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  37.01 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  42.16 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  41.03 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  40.34 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.21 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.55 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  45.26 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.84 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  38.83 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.68 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40.2 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  34.65 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  34.91 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  41.84 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  34.06 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  34.4 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  33.9 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.66 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.69 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  33.86 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  36.11 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.34 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  37.4 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  37.4 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  34.43 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  41.38 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  37.62 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  38.83 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  39.13 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.75 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  43.52 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  41.03 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.69 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  32.28 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  34.96 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  38.3 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  39.33 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  42.71 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  36.44 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  38.58 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  37 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>