275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1093 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  60 
 
 		 146 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  54.08 
 
 		 134 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  57.8 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  47.47 
 
 		 160 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  44.34 
 
 		 123 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  42 
 
 		 125 aa  85.1  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  43.69 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.45 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  43.62 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  41.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  44.21 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  48.94 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  42.59 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  40.95 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  45.92 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  39.8 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  48.89 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  41.76 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  34.04 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  43.52 
 
 		 118 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.81 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  38.32 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.74 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  46.15 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  38.32 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  41.24 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  41.24 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.74 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  41.84 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  43.3 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  48.45 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.89 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.45 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  36.72 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.45 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.43 
 
 		 115 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.04 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  46.99 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  47.42 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.67 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.43 
 
 		 117 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  43.48 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.17 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  38.66 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.35 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  47.5 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.24 
 
 		 120 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  30.09 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.19 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  39.81 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  44.57 
 
 		 117 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  40.43 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  35.58 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  39.18 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  39.25 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  41 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  37.89 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.24 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  50.72 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.24 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.2 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.96 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  29.47 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  35.64 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  38.78 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  36.7 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  40.4 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  32.73 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  36.46 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.82 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  36.97 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  42.16 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.14 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  33.67 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>