More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2007 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  70.73 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  56.6 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  46.28 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  47.37 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  51 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  42.62 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  39.5 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  41.46 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  51.96 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  46.85 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.46 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  43.48 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  33.61 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.4 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  45.95 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  39.84 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  35.25 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  40.32 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  29.66 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  39.8 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  50.5 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  30.51 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.24 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  38.89 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  51.22 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  39.13 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  46.3 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0937  protein of unknown function UPF0102  40.91 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.71 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.92 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  41.53 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  36.07 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.78 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  42.2 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38.38 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  42.42 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  51.61 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  42.42 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  42.42 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  47.19 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  48.51 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  48.51 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.03 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.81 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  47.06 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  45.36 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  45.36 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  37.5 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.58 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  39.58 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.26 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.42 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  40.17 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  37.25 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  37.25 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  40.21 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.39 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  46.73 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  43.97 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  35.24 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  36.73 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  44.33 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  40.4 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.54 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  44.55 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40.71 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  39.22 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.72 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  38.38 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  33 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  36.21 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  43.48 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  40.82 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  29.47 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  34.34 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>