More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1291 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
115 aa  234  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.1 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.26 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  40.71 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.35 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.09 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.74 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  42.48 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40.5 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  40.17 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  40.71 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.46 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  43.1 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  33.96 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  35.04 
 
 
167 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  44.25 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.07 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  43.1 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  41.59 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  37.61 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  40.68 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  37.61 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  45.65 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.21 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.62 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  38.05 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.75 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  40.21 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  43 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  39.39 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  33.05 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  41.28 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.2 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.17 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  38.61 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  32.14 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37 
 
 
134 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  33.66 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  36.28 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  40.54 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  38.39 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  37.84 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  36.75 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  40.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  40.52 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  36.73 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.92 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  38.74 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.9 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  39.13 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  34.75 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  40.37 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  37.82 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.39 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  34.86 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  35.19 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  33.63 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  38.53 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  35.71 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  30.84 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  36.52 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  35.45 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  38.64 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  33.62 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  30.7 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  38.64 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  35.4 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  32.77 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  33.03 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  34.75 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  34.21 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.44 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  34.23 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  38.89 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  32.73 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>