283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_687 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  92.56 
 
 		 121 aa  233  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  82.64 
 
 		 121 aa  207  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.45 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  38.79 
 
 		 125 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  39.66 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  39.66 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.19 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.28 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  42.73 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  44.12 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.24 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  40.32 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  36.21 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  36.84 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.33 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  41.49 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  37.9 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  36.63 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.55 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  39.02 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.59 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  34.45 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.75 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  34.23 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  34.23 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.63 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  35.34 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  33.63 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  34.45 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  42.17 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  34.23 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  36.19 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  33.94 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  36.28 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  42.55 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.68 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  36.28 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  34.75 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  36.97 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  47.83 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  33.03 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  32.08 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  34.65 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.05 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  39.05 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.21 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.65 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  33.9 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.13 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  36.26 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  36.26 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  33.64 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.35 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  37.76 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  32.74 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  36.75 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  28.7 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  35.9 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  40.2 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  31.4 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  35.9 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.19 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  33.93 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.19 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>