290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2213 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 118 aa  234  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  47.17 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  49.09 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  51.28 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  51.28 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  51.28 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  46.36 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.75 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  47.75 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  44.04 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  47.86 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  49.56 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  49.54 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  50.47 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  42.45 
 
 		 117 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  46.23 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  48.65 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  46.43 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  47.79 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  47.57 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  44.66 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  45.37 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  47.27 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  46.23 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  47.79 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  48.65 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  49.56 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  47.46 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  47.37 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  38.39 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  47.37 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  49.11 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  48.21 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  49.11 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  49.11 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  49.11 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  49.11 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  48.48 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  41.82 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  45.45 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  45.13 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  41.12 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  37.96 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  48.11 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  38.05 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  42.48 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  44.92 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0406  hypothetical protein  51.4 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  44.83 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  45.76 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  43.97 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  47.75 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  48.18 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  40.16 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0414  hypothetical protein  50.47 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  44.9 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.7 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.7 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  43.81 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.9 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.18 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38.14 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.94 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  43.97 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  45.92 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  44.14 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  34.02 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  41.96 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  44.25 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.29 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  30.19 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.54 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  39.52 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42.27 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  34.19 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  49.55 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  53.27 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  39.82 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  41.28 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  39.82 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>