268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3046 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  51.09 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  51.61 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  49.46 
 
 		 128 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  45.65 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  54.35 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  49.46 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  49.45 
 
 		 123 aa  84.3  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  49.46 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  54.55 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  46.81 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  46.74 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  47.31 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  39.78 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  44.21 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  46.24 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  38.71 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  47.62 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  40.86 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.48 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  46.74 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  43.96 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  43.01 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  45.26 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  44.21 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  44.21 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  49.41 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.04 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  43.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  45.65 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.65 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  43.62 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  43.62 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  42.55 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  43.48 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  43.18 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.43 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  42.39 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  36.26 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  44.68 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  44.68 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  44.68 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  43.48 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  39.33 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  45.26 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  43.96 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  43.96 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.26 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.95 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  44.12 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  48.31 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.56 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  42.55 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  44.57 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  42.55 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  37.23 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  44.74 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  43.01 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  44.44 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.26 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  45.16 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  47.44 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.16 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  43.18 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  44.57 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37.36 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  43 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.48 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  49.33 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  46.51 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  41.49 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  43.02 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  39.13 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  39.76 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  35.16 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  41.46 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  41.24 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  41.3 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.63 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  39.39 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.18 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  43.33 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  40.43 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  45.33 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  46.25 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>