298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  253  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  96.8 
 
 
125 aa  247  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  66.67 
 
 
119 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  65.22 
 
 
120 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  60.8 
 
 
120 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  55.74 
 
 
123 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  55.04 
 
 
128 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  54.84 
 
 
124 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  57.89 
 
 
123 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  55.46 
 
 
123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  54.62 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  50.43 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  50.88 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  50.88 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  43.31 
 
 
165 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  43.22 
 
 
124 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.72 
 
 
121 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  41.18 
 
 
129 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  48.28 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  48.28 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  40.83 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  47.5 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  47.5 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  47.5 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  47.5 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  46.49 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  49.14 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  46.4 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  43.48 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  47.79 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  46.9 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.79 
 
 
121 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.67 
 
 
125 aa  87  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  41.74 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.34 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  46.28 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  38.79 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  39.83 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.66 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  44.09 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  44.63 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  37.41 
 
 
173 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40.5 
 
 
120 aa  84.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  44.23 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  38.24 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  42.62 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  42.98 
 
 
123 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.14 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40.68 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  49.04 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  45.6 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.72 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  41.23 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  42.42 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  44.8 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  41.03 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  46.53 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  37.29 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  44 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  35.9 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  44.8 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.32 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  40.17 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  37.1 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  28.33 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  38.02 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  39.32 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  37.6 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  43.93 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  44.17 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  36.07 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  41.24 
 
 
202 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  32.46 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.22 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.29 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.48 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  38.94 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  40.19 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  41 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  37.72 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.25 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40.35 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  42.24 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  37.5 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>