More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1406 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
114 aa  226  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  52.78 
 
 
116 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  46.09 
 
 
122 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  47.42 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.47 
 
 
123 aa  94.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.94 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  51 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  43.52 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  45.83 
 
 
127 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  45.92 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  48.98 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  45 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  44.21 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  46.94 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  47.06 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  45.16 
 
 
129 aa  87.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  38.94 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 
121 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  39.32 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.1 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  45.1 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.78 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  37.17 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  43.62 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.28 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  45.74 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  41.88 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  49.06 
 
 
138 aa  84.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  36.61 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  44.23 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  41.96 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.45 
 
 
125 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  47.96 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  44.79 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.32 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  44.21 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  46.32 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  45.26 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  47.96 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  43.27 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.87 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.66 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  44.21 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  45 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.52 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  46.88 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  40.87 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.53 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  41.44 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  37.93 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.11 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  39.47 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  37.84 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  45.16 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.82 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  45.83 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  44.79 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  43.16 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  40.43 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  37.61 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.43 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.26 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  41.28 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  41 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  51.02 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  44.9 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  45.83 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.4 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  42.2 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  43.43 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  42.71 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  44.21 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  45.36 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  41.88 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  39.78 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  37.07 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  35.4 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35.4 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  42.71 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  42.27 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  38.6 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  39.78 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  42.86 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  42.24 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.71 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  47.37 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  43.12 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.642217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>