250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1062 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  277  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0406  hypothetical protein  71.85 
 
 
132 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0414  hypothetical protein  71.11 
 
 
132 aa  168  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  72.99 
 
 
135 aa  166  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  71.55 
 
 
144 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  67.23 
 
 
128 aa  164  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  61.19 
 
 
153 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  65.6 
 
 
123 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  59.85 
 
 
149 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  58.54 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  50.72 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  56.56 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  51.67 
 
 
120 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  49.18 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  54.1 
 
 
118 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  47.2 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  47.41 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  47.41 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  48.15 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  42.24 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  46.4 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  44.83 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  48.7 
 
 
140 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  46.4 
 
 
125 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  42.15 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  47.46 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  42.11 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  43.65 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  45.08 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  43.08 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  44.26 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  49.06 
 
 
114 aa  84.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  42.98 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  46.09 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  44.64 
 
 
108 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  46.22 
 
 
123 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  46.22 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  43.86 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  48.28 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  44.64 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  41.23 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  41.98 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  45.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  41.94 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  41.18 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  42.74 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  39.67 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  41.79 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  48.25 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  41.22 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  45.76 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  40.94 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  45.61 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.61 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  44.09 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  44.07 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  44.07 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  44 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  41.88 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  35.96 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  44.44 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  39.71 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.92 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  37.17 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  39.71 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.8 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  38.97 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  46.08 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  39.29 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.07 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  45.98 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  41.03 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  38.97 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  41.03 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  38.06 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>