299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3311 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  46.27 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  44.78 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  50 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  45.54 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  47.06 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  45.71 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  42.72 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.71 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  44.12 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  45.1 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.67 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.64 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  45.26 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  40.57 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  39.22 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  44.79 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  40.37 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  39.82 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  43.88 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  45 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.26 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  43.3 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  42.11 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  45 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  42.34 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.72 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.94 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  42.16 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  42.71 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  43.48 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  36.61 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  43.16 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.72 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  37.96 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  40.71 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  41.51 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  47.62 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  47.62 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  41.44 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  35.96 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  45.74 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.44 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  42.55 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  43.43 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  34.82 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.94 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  39.86 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  43.43 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  38.95 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.95 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  38.24 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  42.73 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  38.38 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  42.55 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  39.22 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  45.56 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  44 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  42.57 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  36.04 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  34.48 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  45.28 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  39.58 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  39.29 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  41.49 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.61 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  44.04 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  41.41 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.21 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  39.22 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  40.78 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>