More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1272 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
125 aa  261  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  41.88 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  44.14 
 
 
173 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  41.03 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  43.27 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  36.13 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  42.34 
 
 
118 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  42.16 
 
 
139 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  47.42 
 
 
117 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.68 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  39.62 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  42.42 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.6 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.84 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.29 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.04 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  45.92 
 
 
118 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  45.68 
 
 
118 aa  83.6  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.72 
 
 
182 aa  83.6  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  40.17 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.84 
 
 
186 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  41.23 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.33 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.66 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  37.29 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40.19 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  42.2 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  40.38 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  40.19 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  41 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.18 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.16 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40.82 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.29 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.65 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40.59 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  37.74 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.61 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  36.97 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  41.9 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  38.52 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  39.62 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  39.62 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.38 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.64 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.05 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.04 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  36.63 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  40.57 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  38.68 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  32.03 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  35.35 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.62 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.89 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.78 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  39 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  34.96 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.71 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  38.38 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  35.25 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  37.04 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  42.42 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  34.19 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  37.04 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.08 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.97 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  35.24 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  38.38 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.97 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  37.86 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  46.75 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.79 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  41.59 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  37.25 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  39.05 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.19 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  43.62 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  43.62 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  36.11 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.86 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  37.17 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>