297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5877 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  53.39 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  47.41 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  43.97 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  43.97 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  42.61 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.68 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  39.32 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  38.98 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  41.38 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  39.09 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  40.71 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  46.81 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.68 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.6 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.61 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  42.42 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.39 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.74 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  38.18 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  38.18 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.72 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.05 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  38.98 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  34.48 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  36.45 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.04 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.62 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  35.34 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  39.66 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  35.96 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  33.93 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  30.83 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  35.04 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  35.59 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  33.06 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.29 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  32.73 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  36.44 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  33 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  39.45 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  32.43 
 
 		 202 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  40.54 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  35.83 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  34.23 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38.05 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  33.93 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  36.04 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  36.21 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  39.33 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  39.33 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  31.03 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  34.45 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.93 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  35.92 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.45 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  32.43 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  35.78 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  38.61 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  37.61 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  37.61 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  33.86 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  37.61 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  37.61 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  32.77 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  38.68 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>