279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0758 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  55.28 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  47.54 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  44.26 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  42.5 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  45.92 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  41.13 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  41.13 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  45.08 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  43.33 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.82 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  42.15 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  39.67 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  36.36 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  37.19 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  43.3 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  43.69 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.2 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40.65 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.37 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  36.59 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.93 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.46 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  37.61 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  41.8 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  43.56 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  38.71 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.16 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  44.21 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.8 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40.32 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.58 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  37.4 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.66 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  37.38 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  35.04 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  35.16 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  37.93 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  32.26 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  43.4 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.2 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  33.03 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  40.71 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.33 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  35.78 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  32 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.45 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.61 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  35.78 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.04 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  42.15 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.83 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  36.11 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  33.93 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  37.14 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  33.9 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  41.24 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  41.24 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  32.35 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  32.77 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  39.22 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  38.82 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  37.37 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  31.54 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  44.62 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  34.29 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  33.62 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  33.33 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  36.54 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  36.13 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  41.24 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  29.66 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  29.66 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  35.9 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>