292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0460 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 153 aa  313  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  44 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  42.98 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  43.86 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  41.59 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.79 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  43.9 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.87 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.37 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  45.54 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  42.59 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  40.71 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.59 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.88 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  42.02 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  45.1 
 
 		 129 aa  84  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  38.6 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.05 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  37.9 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.39 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.94 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.53 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.74 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  42.73 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  36.13 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  38.32 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.11 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  44.21 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  39.81 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  34.15 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  44 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  40.52 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  40.71 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  41.24 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  34.71 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  30.97 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.1 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42.57 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  47.87 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  41.84 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36.75 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.84 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  42.27 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  39.81 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  32.77 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  34.78 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.13 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  43.88 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  33.06 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  37.1 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  37.1 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  30.97 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  40.62 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.25 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  39.29 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  38.14 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  41.57 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  39.8 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.13 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  34.65 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  33.9 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  36.29 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  39.18 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  38.14 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  41.24 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.18 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.82 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  38.68 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.89 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.81 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.86 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  35.24 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  40.96 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.45 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.86 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  39.39 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  39 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  32.35 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  39.76 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  39.76 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>