249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07020 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  59.13 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  47.83 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0937  protein of unknown function UPF0102  41.46 
 
 		 122 aa  98.2  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.18 
 
 		 123 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.53 
 
 		 119 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.42 
 
 		 118 aa  85.5  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  44.12 
 
 		 115 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  39.83 
 
 		 124 aa  84.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  47.47 
 
 		 126 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  45.19 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.72 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  44.83 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.33 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.99 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  44.23 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  45.1 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.18 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.52 
 
 		 114 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  42.42 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  42.57 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  46.51 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  40.19 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.24 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  40.62 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  41.24 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  44.12 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.58 
 
 		 123 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.35 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  34.55 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.19 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  45.36 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  42.16 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  43.27 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.51 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.39 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  35.92 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.24 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.08 
 
 		 119 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  46.67 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  37.21 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  38.83 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  42 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.59 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  72  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  37.76 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  41.58 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.44 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  33.64 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  44.12 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  39.58 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  36 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  34 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  37.84 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.89 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.96 
 
 		 127 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.46 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.86 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  32.63 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  32.67 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  36.04 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  42.53 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  40.37 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  38.32 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19120  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.37 
 
 		 117 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.651626  normal  0.248755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  37.38 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  38.14 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  34.38 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  36.89 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  34.88 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  38.2 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  32.35 
 
 		 121 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  32 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  51.61 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  34.69 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>