250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0639 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  44.83 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.53 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  41.9 
 
 		 124 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  34.13 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  41.75 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  41.12 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  43.69 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  43.56 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.68 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.51 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.68 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.14 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  32.41 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 118 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  38.53 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  32.5 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  34.26 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.24 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  32.52 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  32.04 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  34.56 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  32.12 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  36.89 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  34.17 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  31.65 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.45 
 
 		 127 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  34.31 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  38 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  43.56 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  39.77 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  36.11 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  38.61 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.36 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  33.96 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  38.61 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  31.73 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  41.58 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  34.48 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  32.43 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  35.51 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  37.74 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  28.93 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  37.74 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  33.94 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  41.03 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  31.85 
 
 		 117 aa  62  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  35.83 
 
 		 122 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  34.95 
 
 		 118 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.75 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  34.45 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.78 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  35.85 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  31.53 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  36.46 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.51 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  33.98 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  30.43 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.24 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  30.08 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  35.09 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  35.09 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.65 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  35 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.62 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  34.62 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  34.91 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  33.98 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  34.34 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  33.96 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  30.83 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  34.62 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  34.62 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  36.73 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>