226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2213 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  261  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  79.49 
 
 
118 aa  190  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  50.42 
 
 
122 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  56.41 
 
 
118 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  42.4 
 
 
132 aa  103  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  50.82 
 
 
122 aa  103  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  52.59 
 
 
121 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  51.72 
 
 
127 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  48.72 
 
 
117 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  47.27 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  48.18 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  47.06 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.54 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  49.14 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  47.37 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  47.37 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  46.02 
 
 
119 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  46.49 
 
 
135 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  52.14 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  48.21 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  42.74 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  43.48 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  44.83 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  44.64 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  42.24 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  45 
 
 
129 aa  88.6  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  47.41 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  44.25 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  43.97 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  38.94 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.71 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  43.36 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  38.26 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  44.79 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.74 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  48.1 
 
 
207 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  46.6 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.59 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40.52 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  39.47 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  44.44 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  44.55 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  39.37 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.86 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.47 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  46.36 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  38.05 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  41.32 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  39.45 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.5 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  35.65 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  35.96 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  31.62 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.58 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35.79 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  38.53 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  44.44 
 
 
160 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.7 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.05 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  37.07 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  39.8 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  41.59 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.24 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  40.18 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  38.14 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  39.05 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.11 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  46.15 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.37 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  31.19 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  33.96 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.24 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  38.46 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  34.55 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.88 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
172 aa  63.5  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  33 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.65 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  41.18 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  41.18 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  36.08 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.28 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  36.08 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  35.19 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  30.85 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>