264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3248 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  243  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  53.91 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  50.88 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  51.3 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  43.41 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  48.31 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  55.65 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  48.33 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  44.25 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  48.36 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  49.14 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  51.35 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  52.21 
 
 		 118 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  47.9 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  46.36 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  47.41 
 
 		 117 aa  96.7  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  46.49 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  57.83 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  54.55 
 
 		 207 aa  90.5  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.75 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  46.09 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  42.74 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  42.74 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  46.9 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  47.01 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  44.14 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  34.62 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  41.88 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.02 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  41.88 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.74 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  47.92 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.84 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.39 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  39.5 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  41.74 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  42.74 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40.19 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.4 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  38.68 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.73 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  32.46 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  39 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  39.66 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.04 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  39.6 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  42.99 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  34.65 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.59 
 
 		 182 aa  73.6  0.0000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.99 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.72 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.89 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  34.02 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.18 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.83 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  33.98 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  38.74 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  43.16 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  32.76 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  44.74 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  44.74 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  38.3 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.27 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  43.97 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  36.44 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.84 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  36.11 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  37.76 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0358  protein of unknown function UPF0102  45.71 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.76 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.24 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.59 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.98 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  42.47 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  49.28 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.38 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  43.43 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.28 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  36.46 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  47.87 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>