265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0553 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  47.83 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  49.09 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.85 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  45.05 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  43.64 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.28 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.45 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  41.44 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  51.82 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.64 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  41.44 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  44.04 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  45.05 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  43.4 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.47 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  45.05 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  42.06 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  43.75 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  41.28 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  46.73 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  45.87 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.94 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  39.82 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.11 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  46.02 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  52.63 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42.34 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  43.12 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  42.45 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  39.83 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.95 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  39.81 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  42.45 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.83 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.74 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.17 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  35.11 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  42.59 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  39.47 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  38.26 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  48 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.45 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  41.82 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  40.37 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  38.89 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.73 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  33.93 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  46.67 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  39.62 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  39.62 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  39.25 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  42.05 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  43.16 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.71 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  35.96 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  36.28 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.04 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  35.78 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  30.09 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  38.94 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  28.7 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  40.18 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  41.59 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.04 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  34.23 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  39.45 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  33.7 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  39.45 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  39.45 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.28 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  38.74 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  38.94 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  35.19 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  34.23 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.04 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  28.7 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.6 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  39.13 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  52.46 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  39.45 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.04 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  37.78 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  37.78 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  39.18 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>