204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3909 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.67 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  44.12 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  42.98 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  42.45 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  41.9 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  43.3 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  55.38 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  42.27 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  42.27 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.93 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.91 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  32.26 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  39.58 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  36.22 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.02 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  42.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  41.88 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  36.8 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  30.47 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  41.75 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  34.48 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  38.6 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.73 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  27.83 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  40.19 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  40.62 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  39.51 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.17 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  33 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  35.16 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  29.82 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  34.65 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  34.43 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  37.84 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  34 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  35.29 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  41.12 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  34.45 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  36.7 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  35.59 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  28.46 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  38.61 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36.21 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.39 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.52 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  44.66 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  41.05 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  34.82 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  31.58 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  35.96 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  38.02 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  31.03 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  34.26 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  36.61 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  29.91 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.19 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  41.24 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.98 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  36.75 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  41.56 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  28.1 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  31.3 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  35.85 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  39.81 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  44.78 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  36.75 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  36.75 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  34.91 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  33.6 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  34.65 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.89 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  28.93 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  32.46 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  36.27 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>