274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3693 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  86.11 
 
 
108 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  85.19 
 
 
108 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  85.19 
 
 
108 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  84.26 
 
 
108 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  189  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  189  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  189  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  189  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  62.86 
 
 
117 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  60 
 
 
114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  59.05 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  63.81 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  58.33 
 
 
108 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  42.86 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  47.62 
 
 
120 aa  95.9  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  45.19 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  45.19 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  45.19 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  45.37 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  45.87 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  47.71 
 
 
128 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  44.04 
 
 
113 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  47.66 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  45.54 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  46.43 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  46.43 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  46.36 
 
 
125 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  46.36 
 
 
125 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  40.37 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  42.2 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  46.73 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  44.04 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  46.73 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  46.73 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  46.43 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  46.73 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  46.73 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  46.73 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  46.73 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.44 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  42.2 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  42.99 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  41.44 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  46.36 
 
 
160 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  47.27 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  46.43 
 
 
154 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  46.02 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  42.59 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  40.74 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  43.93 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  44.92 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  40.74 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 
131 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  45.54 
 
 
140 aa  84.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  46.6 
 
 
130 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  43.52 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  42.59 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  42.59 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  44.34 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  42.2 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  44.04 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0406  hypothetical protein  49.54 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  44.04 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.19 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  40.54 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  40.74 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  37.38 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0414  hypothetical protein  48.62 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  43.93 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  43.93 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  40.52 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  39.81 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  42.34 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  43.93 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  43.93 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  43.93 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  36.63 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  40.74 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  42.2 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  43.93 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  43.22 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  41.35 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  40.74 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 
165 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>