291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2148 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  64.06 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  53.97 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  48.51 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  57.8 
 
 		 202 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.02 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  45.13 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  39.5 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.35 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.5 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  43.22 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.34 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.28 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  36.04 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  41.38 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.52 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.17 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.91 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  33.64 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  45.05 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.53 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  43.16 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.32 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  39.64 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35.59 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  39.68 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.23 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.29 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  34.71 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  37.61 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  37.61 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  34.71 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  35.65 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  31.15 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40.94 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  28.32 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.94 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.25 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.44 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.72 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  43.7 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  40.35 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  35.4 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  38.39 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  39 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  39.58 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  34.78 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  30.51 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  45.35 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  39.17 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  31.82 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  37.39 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  32.2 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.17 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  38.18 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  34.91 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  30.63 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  37.72 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  35.34 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  35.54 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  40.18 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  35 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.53 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  39.13 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  33.66 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.62 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  29.57 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  37.39 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  38.94 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  38.94 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  37.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  36.11 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  34.29 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.64 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  39.13 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  41 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>