298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004502 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  88.52 
 
 		 122 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  52.54 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  43.22 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  44.17 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  43.22 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  46.49 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  42.37 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  42.37 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  42.37 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  42.37 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  47.01 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  39.83 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  39.83 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  43.1 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  38.98 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  43.24 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  45.3 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  43.97 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  43.8 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  43.1 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  43.1 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  43.1 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  44.35 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  42.5 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  40.87 
 
 		 111 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  47.46 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  47.46 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  41.28 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  43.48 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  41.82 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  41.44 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  39.47 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  39.32 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.23 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40.18 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  39.17 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  39.64 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  37.61 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.64 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  37.93 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  46.02 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.29 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.18 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  42.57 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  42.57 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45.36 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  35.34 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  35.34 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.29 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  39.09 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  40.37 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  42.16 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  39.09 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  44.79 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  38.89 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  39.45 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  35.4 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  35.9 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  40.52 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  35.59 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  43.81 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  38.18 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  41.88 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.14 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  40.54 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  39.13 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  39.45 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  36.61 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  38.26 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  43.81 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  39 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  38.32 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  38.32 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  38.18 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>