More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0315 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  52.17 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  50.41 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  56.67 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  52.21 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  52.21 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  47.41 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  50.88 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  44.92 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  50.88 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  51.69 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  46.61 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  50.85 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  52.99 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  47.54 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  42.62 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  47.27 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  50.4 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  50.4 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  49.15 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  50.45 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  47.75 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  50.43 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  51.35 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.39 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  48.15 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  42.74 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  40.98 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  46.79 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.18 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  43.36 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  40.91 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  47.41 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  42.2 
 
 		 172 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  45.61 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  48.21 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  45.38 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  45.38 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  47.32 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  44.54 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  44.54 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  46.22 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  44.54 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  44.54 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  50.43 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  45.38 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  45.1 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  47.11 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  44.54 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  47.11 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  47.5 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  47.11 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  44.74 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  44.74 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  44.74 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  44.74 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  47.5 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  47.5 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  44.74 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  47.5 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  46.6 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  42.98 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  40.83 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  42.98 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  42.64 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  45.53 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  48.28 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  43.22 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40.34 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  40.17 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2205  hypothetical protein  50.85 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0799799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  50.41 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.94 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  44.95 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.82 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  45.26 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  37.96 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  38.53 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  48.94 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  42.59 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.23 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  43.12 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  46.02 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  45.61 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  42.61 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  42.61 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  42.48 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>