278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0351 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  75.21 
 
 		 117 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  61.32 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  62.86 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  62.86 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  62.86 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  61.9 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  61.9 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  61.9 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  61.9 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  61.9 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  60.95 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  60.95 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  54.29 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  56.19 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  51.43 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  42.34 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  42.34 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  42.34 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.81 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  43.22 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41.51 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  40.34 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  43.93 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  42.37 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  40.34 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  43.93 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  40.34 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  40.34 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  40.34 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  40.35 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  44.14 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  41.28 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  38.05 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  42.34 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  37.07 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  37.07 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  36.21 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  41.44 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  37.07 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  37.07 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  41.9 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  36.21 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  41.44 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  36.21 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  37.07 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  39.66 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  42.72 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.04 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  39.66 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  39.66 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  39.47 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2205  hypothetical protein  44.95 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0799799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  37.62 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.7 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  42.06 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.74 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35.2 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  37.61 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  36.04 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  38.39 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  32.77 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  37.7 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  39.25 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  39.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  37.07 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  37.27 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  36.94 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  39.25 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  30.53 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.62 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  38.26 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  38.74 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.27 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  38.74 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  35.09 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.17 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.91 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.6 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.17 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  34.71 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  36.7 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.54 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>