252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0307 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  240  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  93.22 
 
 		 118 aa  226  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  79.82 
 
 		 117 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  72.17 
 
 		 118 aa  170  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  72.97 
 
 		 113 aa  168  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  70.69 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  70.69 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  70.69 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  60.53 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  60.53 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  60.53 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  60.53 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  59.65 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  59.65 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  58.77 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  58.77 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  58.77 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  58.77 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  59.65 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  59.65 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  58.77 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  54.78 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  53.98 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  63.41 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  51.3 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  51.3 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  51.3 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  51.3 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  51.3 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  51.3 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  51.3 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  51.33 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  50.43 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  49.57 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  43.97 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  49.57 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  51.85 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  43.97 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  50.43 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  44.83 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  41.07 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  42.2 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  44.55 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  46.96 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  44.14 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  40.91 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  46.96 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  45.61 
 
 		 124 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  43.1 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  42.61 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  45.87 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  44.74 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  47.37 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  47.37 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  40.54 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  42.48 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  48.15 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  45.13 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  48.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  39.09 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  45.05 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  45.22 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  42.74 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  40.74 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  42.02 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  37.38 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.9 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  39.32 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  43.8 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.74 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  43.1 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>