229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0391 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  74.51 
 
 		 153 aa  221  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  65.08 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  59.85 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  62.2 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  61.07 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0406  hypothetical protein  58.73 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0414  hypothetical protein  57.94 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  60.16 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  57.6 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  58.27 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  58.06 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  44.53 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  46.32 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  50.83 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  51.54 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  46.34 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  48.03 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  49.59 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  49.59 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  49.59 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  49.59 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  45.38 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  47.59 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  48.76 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  43.97 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  43.26 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  49.22 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  43.06 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  39.68 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  43.57 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  44.09 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  44.35 
 
 		 123 aa  85.5  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  44.09 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  44.92 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  44.92 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  44.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  43.33 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  43.85 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  42.15 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  43.33 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  42.42 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.6 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  44.72 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  44.72 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  39.83 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  41.44 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  38.58 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  39.37 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  42.37 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  42.37 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  42.37 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  42.37 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  44.92 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  43.51 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  43.51 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  42.57 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  44.92 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  43.51 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  43.9 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  43.61 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  50 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  40.15 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  35.92 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  35.83 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  43.33 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  39.01 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  42.31 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  37.7 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  34.81 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  46.79 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  44.04 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  34.96 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  41.41 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  41.41 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>