268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3454 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  99.24 
 
 
131 aa  267  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  83.97 
 
 
131 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  83.21 
 
 
131 aa  231  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  83.21 
 
 
131 aa  231  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  83.21 
 
 
131 aa  231  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  83.21 
 
 
131 aa  231  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  81.68 
 
 
131 aa  228  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  81.68 
 
 
131 aa  228  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  82.44 
 
 
131 aa  227  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  72.87 
 
 
131 aa  197  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  86.52 
 
 
89 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  61.4 
 
 
118 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  60.87 
 
 
117 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  64.42 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  60.53 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  58.77 
 
 
118 aa  135  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  57.39 
 
 
117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  57.39 
 
 
117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  57.39 
 
 
117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  47.01 
 
 
120 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  42.37 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  53.91 
 
 
160 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  42.37 
 
 
122 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  48.7 
 
 
122 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  51.3 
 
 
121 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  50.89 
 
 
137 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  49.12 
 
 
131 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  45.61 
 
 
129 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  50.44 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  47.5 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  50.43 
 
 
160 aa  95.9  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  47.62 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  50.43 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  50.43 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  46.96 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  50.43 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  50.43 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  50.43 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  47.97 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  50.43 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  47.9 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  49.12 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  39.83 
 
 
122 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  47.97 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  47.2 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  52.83 
 
 
130 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  42.59 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  41.18 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  46.4 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  46.4 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  42.74 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  45.69 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  40.83 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  43.9 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  44.54 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  40.34 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  45.86 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  48.67 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  47.27 
 
 
118 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  46.79 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  42.11 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  42.11 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  47.37 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  40.87 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  40.87 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  40.87 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  46.43 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  84.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  45.08 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  44.54 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  42.2 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  42.59 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  44.63 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.74 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  44.74 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  42.28 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  41.54 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  39.81 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  41.28 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  39.82 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  37.8 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  33.93 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>