More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2103 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  244  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  49.14 
 
 
123 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  46.83 
 
 
124 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  52.17 
 
 
131 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  51.3 
 
 
131 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  52.17 
 
 
131 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  52.17 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  52.99 
 
 
121 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  52.99 
 
 
121 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  45.53 
 
 
123 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  48.65 
 
 
120 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  46.72 
 
 
125 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  47.83 
 
 
131 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  46.72 
 
 
125 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  50.43 
 
 
131 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  42.64 
 
 
128 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  47.27 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  43.7 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  46.61 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  48.7 
 
 
120 aa  96.7  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  51.38 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  47.17 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  49.11 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  50.46 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  48.18 
 
 
123 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  48.7 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  48.65 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  37.72 
 
 
118 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  46.85 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  48.76 
 
 
160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  50.89 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  48.76 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  50.89 
 
 
160 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  48.21 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  46.4 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  45.37 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  46.4 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  46.79 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  50.89 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  47.66 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  50.89 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  50.89 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  38.71 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  46.49 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  45.71 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  41.28 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  54.65 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  50.46 
 
 
160 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  41.9 
 
 
108 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  43.24 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  48.25 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40.52 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  48.25 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  48.25 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.17 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  37.27 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2205  hypothetical protein  57.01 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0799799  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  45.79 
 
 
108 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  49.54 
 
 
156 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  49.54 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  45.79 
 
 
108 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  44 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  42.28 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  43.93 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  49.07 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  46.02 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  49.54 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  44.86 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  49.54 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  37.93 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  44.76 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  39.47 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  46.02 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  44.76 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  40.52 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  44.76 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  44.76 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  46.43 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.41 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  48.21 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  48.62 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  38.14 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  47.32 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.18 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37.84 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  37.84 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>