296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1324 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  98.37 
 
 		 123 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  96.75 
 
 		 123 aa  246  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  86.18 
 
 		 123 aa  219  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  58.2 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  63.11 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  56.69 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  55.65 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  54.84 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  54.84 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  53.78 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  52.21 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  52.21 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  52.54 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  46.67 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.83 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  50.88 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  50.88 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  46.88 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  46.09 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  51.28 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  49.55 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  48.76 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  40.87 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  40.87 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.94 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  46.28 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  46.61 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  45.87 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  47.15 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  47.15 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  47.15 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  40.5 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  41.74 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  45.54 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  47.15 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  47.83 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  42.37 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  47.9 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  44.74 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  47.79 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  44.63 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  47.5 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40.5 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  44.25 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  52.63 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  46.34 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  53.72 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  34.96 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  43.86 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  41.88 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  48.28 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  48.7 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40.6 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  45.54 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  48.25 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  48.67 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  42.24 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40.16 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  40.5 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  45.08 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.94 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  40.32 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  43.31 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  44.25 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  36.36 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  40.71 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  42.15 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  37.9 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.32 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  39.66 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2205  hypothetical protein  50.83 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0799799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>