292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4685 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  67.54 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  64.66 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  60.63 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  63.93 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  60.8 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  63.11 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  61.54 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  63.11 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  63.93 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  50.91 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  46.67 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  43.36 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  50.45 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  46.61 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  43.65 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.61 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  47.37 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  51.82 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  51.82 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  49.56 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  44.83 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  48.65 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  47.75 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  47.37 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  47.86 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  47.86 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  47.86 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  47.32 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  47.27 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  44.35 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  49.15 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  42.73 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  46.15 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  41.07 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  39.82 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  44.55 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41.44 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  44.83 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  47.27 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  39.83 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  44.14 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  42.98 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  44.55 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  46.43 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  43.59 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  42.98 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  43.97 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  42.15 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  47.27 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  44.04 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40.83 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  47.27 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  45.13 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  47.27 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.14 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  39.13 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  41.07 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  47.27 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  38.74 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  47.27 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  47.27 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  47.27 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  40.68 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  44.9 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  45.45 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  42.48 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  41.44 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2205  hypothetical protein  49.14 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0799799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  44.55 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  38.64 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  45.26 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  46.08 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  42.62 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  39.82 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  43.93 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  39.29 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  45.05 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  39.82 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  39.82 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  40.37 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  40.37 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  40.37 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  47.01 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>