239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3900 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  97.92 
 
 
160 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  97.22 
 
 
160 aa  276  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  96.53 
 
 
144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  86.62 
 
 
160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  65.73 
 
 
142 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  66.2 
 
 
142 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  66.2 
 
 
142 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  65.03 
 
 
142 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  67.13 
 
 
137 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  64.34 
 
 
158 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  71.77 
 
 
128 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  60.84 
 
 
156 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  60 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  66.93 
 
 
140 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  54.7 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  54.7 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  54.7 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  52.1 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  54.87 
 
 
125 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  54.87 
 
 
125 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  51.28 
 
 
117 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  52.94 
 
 
118 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  52.54 
 
 
118 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  51.3 
 
 
118 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  48.72 
 
 
131 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  50.41 
 
 
131 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  54.81 
 
 
130 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  55.26 
 
 
136 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  49.59 
 
 
131 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  48.78 
 
 
131 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  48.72 
 
 
128 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  49.59 
 
 
131 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  49.59 
 
 
131 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  52.83 
 
 
120 aa  98.6  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  52.73 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  50.43 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  50.43 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  50.43 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  55.26 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  50.43 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  50.43 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  48.76 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  47.54 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  48.76 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  48.76 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  53.51 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0406  hypothetical protein  54.31 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0414  hypothetical protein  54.31 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  49.17 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  48.78 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  49.17 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  49.56 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  48.33 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  44.17 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  50.89 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  48.78 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  51.3 
 
 
134 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  46.73 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  42.99 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  47.27 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  42.99 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  53.77 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  42.99 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  42.99 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.11 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  47.11 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  45.1 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  44.26 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  35.83 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  51.72 
 
 
135 aa  84  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  49.11 
 
 
123 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  41.88 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.17 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  45.6 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  42.06 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  40.74 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  43.8 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  44.8 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  42.99 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  40.35 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  42.99 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  38.79 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  35.78 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  41.12 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  42.06 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  38.68 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  40.57 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  53.01 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  44.64 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>