272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3440 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
150 aa  289  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  50.43 
 
 
118 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  46.34 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  49.56 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  47.76 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  45.13 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  49.56 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  49.56 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  49.56 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  39.83 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  46.15 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  47.46 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  36 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  45.3 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  45.22 
 
 
119 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  46.55 
 
 
117 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  46.34 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  46.85 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  46.28 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.28 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  46.34 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.66 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  46.34 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  49.19 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  44.88 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  39.52 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  46.02 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  49.19 
 
 
125 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  45.95 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  48.7 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  48.74 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  47.37 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  48.39 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  48.28 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  45.67 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  33.04 
 
 
123 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  49.11 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  43.09 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  45.97 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.79 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  39.13 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  42.34 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  42.48 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40.83 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40.83 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  49.57 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  43.22 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  49.57 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40.83 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40.83 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  50.93 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.26 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  43.24 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  41.73 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  46.61 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  45.45 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  48.72 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  41.9 
 
 
173 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  42.34 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  48.72 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  48.72 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  48.72 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  48.72 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  40.54 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.07 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  41.44 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  48.65 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  39.82 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  37.82 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  45.54 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.81 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  48.72 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  42.34 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  45.67 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  48.03 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  42.03 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  46.49 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  33.87 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  45.32 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  46.67 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.23 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  44.92 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  45.32 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  36.52 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.48 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  47.96 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>