292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4996 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  96.8 
 
 
125 aa  247  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  65.29 
 
 
119 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  64.35 
 
 
120 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  60 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  55.74 
 
 
123 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  55.04 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  54.84 
 
 
124 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  55.83 
 
 
123 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  55 
 
 
123 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  53.72 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  49.57 
 
 
113 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  50.88 
 
 
121 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  50.88 
 
 
121 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  45.9 
 
 
165 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.72 
 
 
121 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  40.34 
 
 
118 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  48.31 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  39.67 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  48.31 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  41.53 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  46.67 
 
 
118 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  47.93 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  46.49 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  45.83 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  45.83 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  45.83 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  42.02 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  47.79 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  46.4 
 
 
138 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.14 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  38.79 
 
 
121 aa  87  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  41.74 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.83 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  44.09 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  42.62 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45.13 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  46.28 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  42.24 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.35 
 
 
125 aa  84  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  43.8 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  38.24 
 
 
172 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  43.18 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  42.62 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40.68 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  36.75 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.93 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  36.69 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.14 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.14 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  40.34 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  41.23 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.72 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  43.27 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  32.77 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  44.8 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  43.65 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  46.53 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  44 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.29 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  43.65 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  40.17 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  43.2 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  46.79 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  43.2 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.29 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  43.2 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  43.2 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  43.2 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  39.32 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  42.02 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  41.46 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  41.24 
 
 
202 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.59 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  37.8 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  36.8 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.07 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  44.83 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  31.36 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  41.32 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.61 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  37.04 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  29.2 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  42.11 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  36.97 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  40.19 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  41.41 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  38.05 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  35.04 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  35.25 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>