297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2217 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  248  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  46.67 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  47.83 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  41.53 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  48.28 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  46.96 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  48.25 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  46.55 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  49.57 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  44.17 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  39.62 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45.13 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  45.83 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  38.68 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.41 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  41.38 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  43.48 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.05 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  41.82 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  42.62 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  42.48 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  42.62 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.94 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  47.9 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  46.09 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  46.36 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  47.71 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  45.65 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  45.65 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.9 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.22 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.75 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.7 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.54 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  34.75 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.13 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  48.21 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  43.22 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  44 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  44.21 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  38.94 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  44.54 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  41.28 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  44.54 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  40.35 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  44.79 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  43.3 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  43.3 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  43.3 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  44.55 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  43.3 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  38.05 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  41.23 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  38.94 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  36.94 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.52 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.58 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.85 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  42.27 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  39.13 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  45.95 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  41.07 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  36 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.98 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  43.24 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  41.28 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  46.02 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  46.49 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  37.29 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.07 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.85 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  35.45 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  35.04 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  46.46 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  47.5 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  42.61 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.38 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.38 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.74 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  39.67 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.17 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  44.59 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>