294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0016 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  65.6 
 
 		 126 aa  169  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  63.78 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  60.83 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  63.41 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  48.06 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  46.72 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  47.15 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  41.03 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  43.55 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  40.17 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  42.4 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.02 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  39.17 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  44.55 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  47.47 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  37.29 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  47.06 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  45.83 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  44.07 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  45.71 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  39.02 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  46.81 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  44.12 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.26 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  42.28 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  46.39 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  46.39 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42.42 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  42.5 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.58 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.6 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.71 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.13 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  46.6 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.03 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  47.42 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  44.12 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  42.02 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  42.02 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  44.68 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  45.3 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  43 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  43.14 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  42.71 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  42.62 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  43 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  42.27 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  45.26 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  40.83 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40.82 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.53 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.13 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  44.23 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  39.64 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  40 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  43.14 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  43.56 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  42.28 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40.62 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  36.59 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  39.52 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  39.5 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  40.57 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  40.78 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  40.78 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.32 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  41.53 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  39.18 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  44.12 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  37.21 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.92 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  40.21 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  38.95 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  38.89 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  41.35 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41.49 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  39.58 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  36.46 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  35.23 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  35.48 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  36.22 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  38.89 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  43.16 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  40.4 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  43 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>