238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1509 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  261  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  45.79 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  45.79 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  41.9 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  44.34 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  43.4 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  44.34 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  43.69 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  50 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  43.81 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  44.59 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  32.74 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  42.98 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  40.78 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  31.86 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  36.79 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  27.83 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  45.54 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  41.28 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  30.09 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  35.19 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  45.54 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.19 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  40.48 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.01 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  35.45 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.98 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  42.06 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.04 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  37.14 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  30.63 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.36 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  36.27 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  32.48 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.85 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  33.77 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  33.03 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  33.02 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.75 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  32.71 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  37.5 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.14 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  44.59 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  29.25 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  32.46 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.75 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  23.81 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.06 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.44 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  40.54 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.98 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  36.73 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  29.41 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.59 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  26.88 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  32.29 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.25 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  24.04 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  31.71 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  27.03 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.8 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  27.83 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.55 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  31.68 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  28.03 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  28.03 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  33.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  29.36 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  36.96 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  36.49 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.71 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  29.13 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  27.78 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  31.53 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  38.39 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.94 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  40.43 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  31.58 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  28.24 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  32.95 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>