206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1413 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  61.61 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  54.46 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  55.86 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  47.17 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  41.9 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  32.61 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  39.42 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  28.44 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  29.03 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.19 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  34.09 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  29.36 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  29.81 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  43.4 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.38 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  46.77 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  29.09 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  44.59 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  31.91 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  26.13 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  43.42 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  38.37 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  28.71 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.71 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  30.39 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  26.21 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  36.67 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  24.27 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.36 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  49.02 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  40.82 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  27.52 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  43.33 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  28.57 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  34 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  28.57 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  33.02 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  54.17 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.02 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.4 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  37.14 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  33.67 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  31.52 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  26.85 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  33.01 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.71 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  26.09 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  26.05 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.98 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  30.84 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  30.53 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  35.96 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  26.26 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  46 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  31.37 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  28.12 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  34.55 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  28.07 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.74 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  30.84 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  25.77 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  25.25 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  27.27 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  28.87 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  28.97 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  31.07 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  46.15 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  32.47 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  26.67 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.93 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  31.46 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  25.25 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>