173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3496 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  246  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  60.36 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  59.32 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  59.32 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  43.97 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  48.18 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  55.45 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  47.27 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  50.94 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  46.49 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  41.23 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  47.27 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  46.36 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  45.87 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  40.35 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  47.17 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  56.03 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  45.28 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  56.03 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  45.76 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  39.83 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  40.91 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  44.64 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  38.14 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  39.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.35 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  36.45 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  44.3 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.82 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.56 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  40.37 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  42.39 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  31.91 
 
 		 112 aa  57  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  36.08 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  37.37 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  47.06 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  37.89 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  41.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  37.89 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  33.67 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  41.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  39.53 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  37.04 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.59 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.68 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  30.86 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  36.45 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.78 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  38.27 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.11 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  36.56 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.05 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  40.51 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35.44 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  25 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.77 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  35.44 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  33.03 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.54 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  35 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  39.24 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  30.65 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  38.04 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.63 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.04 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  31.37 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  32.53 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  26.67 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  46.67 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  30.39 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  40.24 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  36.25 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  29.47 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  36.47 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.77 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  33.94 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.73 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  30.97 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  31.96 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  31 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  29.55 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  36.71 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  36.25 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  58.14 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>