108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2938 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  59.35 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  57.72 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  61.61 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  49.11 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  43.97 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  58.27 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  57.02 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  44.25 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  45.79 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  42.74 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  41.32 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  41.18 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  40.52 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  41.53 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  43.52 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  37.39 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  39.82 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  38.53 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  37.17 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  37.17 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  41.28 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  36.52 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  36.45 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  38.98 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  31.25 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  30.97 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  37.63 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  36.73 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.37 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  36.27 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  39.25 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  36.54 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  34.41 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.41 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  29.2 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  38.67 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  38.67 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  37.63 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.59 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  34.23 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.38 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  40.26 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  28.45 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  34 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.02 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  37.31 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  32.98 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  32.11 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  26.8 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.94 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  33.75 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  31.96 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  35.42 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  37.66 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  27.66 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  34.15 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  34.29 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  38.75 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  62.86 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  33.67 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  28.75 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  37.66 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  40.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  34.62 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  30.63 
 
 		 118 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  39.44 
 
 		 123 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  36.47 
 
 		 202 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  33.78 
 
 		 121 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  33.78 
 
 		 121 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  39.39 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32.26 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.9 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  36.73 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  40.54 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  40.54 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  41.82 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>