160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0175 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  268  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  45.8 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  45.28 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  47.37 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  37.01 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  46.85 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  43.33 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  43.9 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  46.85 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  40.94 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  41.51 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  45.79 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  43.86 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  40.2 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  40.52 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  42.37 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  39.67 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  41.53 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  46.15 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  36.21 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  28.46 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  42.64 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  40.59 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  42.64 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40.18 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  26.89 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  39.42 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.28 
 
 		 167 aa  57  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  38.53 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  40.74 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  30.53 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  30.3 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  44.57 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  33.65 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  33.65 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  30.36 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.69 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.76 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.58 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  44.74 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  33.82 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  36 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  48.89 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  44.21 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  32.17 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  39.13 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  31.96 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  32.29 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  27.1 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0358  protein of unknown function UPF0102  37.14 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  35.92 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  37.11 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  31.96 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  31.62 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  30.25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  42.34 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  32.17 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  30 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  26.13 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.76 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  34.69 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  33.86 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  29.17 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  30.09 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  30.48 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  30.53 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  37.89 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  29.17 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  30.53 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  30.19 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.54 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  35.83 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  32.08 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  30.97 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  32.54 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>