257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0178 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  249  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  85.6 
 
 		 125 aa  219  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  66.96 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  64.55 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  56.78 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  62.62 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  59.29 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  53.1 
 
 		 128 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  60.19 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  52.14 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  51.33 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  52.14 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  51.3 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  48.67 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  50.94 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  47.79 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  48.31 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  48.31 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  43.1 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  48.62 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  47.37 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  41.32 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  49.58 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  46.79 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  42.37 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  40.57 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  43.69 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  39.39 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.78 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  37.89 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39.39 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  39.05 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  39.58 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.05 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.05 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  33.65 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.05 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  39.78 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.42 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.54 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.34 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.17 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.8 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  41.77 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.82 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  37.76 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  39.62 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  37.96 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  36.08 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.8 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.95 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  38 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.3 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  30.1 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.63 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  30.21 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.95 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  34.58 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  32.73 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  32.65 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  34.74 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.91 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  27.55 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  39.58 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  41.05 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  38.38 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  29.41 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  40.19 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  35.24 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  36.08 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  24.74 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  31.13 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  31.13 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  39.18 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.42 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  36.13 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  38.54 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>