193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0572 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  228  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  64.95 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  58 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  41.53 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  45.95 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  46.23 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  40.71 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  43.36 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  42.73 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  43.86 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  40.71 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  38.26 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  40.57 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  35.96 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  38.94 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  39.25 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  42.61 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.89 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  37.27 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  42.61 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  31.09 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  36.45 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  39.29 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  37.17 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  29.57 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  38.05 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  39.29 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  43.88 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  38.79 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  31.97 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  29.25 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.27 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  30.19 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  35.11 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  35.92 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  35.35 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.64 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  31.91 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.99 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  46.94 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.27 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  30.28 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  36.52 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.3 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.84 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.89 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  35.42 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.1 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  24.47 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.11 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.77 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  43.14 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.11 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  29.82 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  34.38 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  26.09 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  33.01 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  30.11 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  24.73 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  36.49 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  27.78 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  29.79 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  24.73 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  41.03 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  36.63 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  23.66 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  29.27 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  28.21 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  32.99 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  37.23 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  42.55 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  39.42 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  34.58 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  49.06 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  35.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  39.47 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  29.81 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  36.17 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  25.66 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  27.1 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>