281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0339 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  243  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  52.89 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  53.91 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  53.72 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  50.86 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  51.3 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  51.72 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  51.3 
 
 		 118 aa  103  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  44 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  45.08 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  44.8 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  42.61 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  45.69 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  43.93 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  41.59 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  45.05 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  48.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  44.25 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  52.13 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  48.72 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  42.99 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  46.4 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  41.44 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.07 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  36.89 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  38.46 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41.07 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  41.75 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.29 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  39.32 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  39.32 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  45.97 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  28.21 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  38.89 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.89 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  46.99 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  36.08 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1814  hypothetical protein  42.59 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.94 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  40.35 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  33.88 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0461  hypothetical protein  42.59 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  41.53 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  34.51 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  34.15 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0472  hypothetical protein  43.36 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.94 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  37 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  39.42 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  37.37 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  35.16 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  42.34 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  47.5 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  38.78 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  42.45 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  37.63 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  39.09 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  38.39 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  33.62 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  26.17 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  35.4 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  43.04 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.67 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.35 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  37.84 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  31.58 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.4 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  35.77 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  37.84 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.14 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  27.83 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  30.91 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  38.18 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>