159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2830 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  263  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  46.46 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  41.05 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1814  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0461  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0472  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  40.71 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  41.12 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  39.18 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  35.45 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  40.51 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  41.77 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  36.08 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  39.51 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  36.08 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  45.36 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  35.05 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.81 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  39.24 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  32.32 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  28.04 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  31.25 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  30.3 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.67 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  40.23 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  34.74 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  44 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  44 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  30.61 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  34.94 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  34.21 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  31.86 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  34.02 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  32.32 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  28.12 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  37.35 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  31 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  32.67 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  37.78 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.14 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  30.84 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  41.49 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  30.3 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  39.24 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  33.66 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  30.19 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  35.71 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  31.33 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  38.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  28.4 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  34.38 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  23.68 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  28.4 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  27.16 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  32.54 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  32.32 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  34.57 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.73 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  37.31 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  36.63 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  36.63 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  27.72 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  32.32 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  31.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.62 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  29.35 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  29.29 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  31.68 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  29.73 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  26.88 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  31.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  30.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  26.88 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  29.73 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  35.35 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>