254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0293 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 124 aa  246  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  60.36 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  57.76 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  57.76 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  47.79 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  48.67 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  49.11 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  47.86 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  56.9 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  47.86 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  54.95 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  46.15 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  47.86 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  48.18 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  40.87 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  45.3 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  44.74 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  41.96 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  44.55 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  47.32 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  41.23 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  55.65 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  42.34 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  46.07 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  47.5 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  36.46 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.87 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  39.09 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  42.42 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  47.44 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.98 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  45.28 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.7 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  44.87 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.7 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  46.32 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  50.79 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  50.79 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  43.04 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  43.04 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  43.75 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  39.58 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  30.85 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  41.9 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  37.23 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  37.37 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  37.37 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40.74 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  38.53 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.48 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.81 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.05 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.56 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.65 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  35.92 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.95 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  36.96 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  41.25 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  41.98 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  35.96 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  41.46 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.68 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  36.08 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  34.41 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  29.63 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  33.33 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  40.45 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  34.41 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.27 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  34.34 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40.98 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  35.42 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.48 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  42.5 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  32.97 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  40.54 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  34.95 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.44 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>