244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0170 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  47.17 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  50.5 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  50.5 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  49.5 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  48.11 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  47.17 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  49.51 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  42.59 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.9 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  37.11 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  32.35 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  34.44 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  38.71 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  37.89 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  36.79 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  31.86 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  34.41 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  34.94 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  30.84 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  33.04 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  37.14 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  31.31 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  30.84 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  44.16 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.14 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  27.88 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  30.21 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  32.38 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.58 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  44.16 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.58 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  40.96 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.14 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.46 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.95 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.74 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.33 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  35.35 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  33.64 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  36.25 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  34.69 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  29.09 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  25.69 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  32.43 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  31.33 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  29.52 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  33 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  27.78 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  30.61 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  34.29 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  28.3 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  28.18 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  30.48 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  31.19 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  32.32 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  32.32 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  28.18 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  30.63 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  28.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  28.42 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  28.43 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  36.56 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  30.3 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  27.36 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  26.53 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  31.33 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  28.12 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  27.08 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  31.46 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  30.53 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>